實時熒光PCR技術(shù)是一種在DNA擴增反應(yīng)中,以熒光化學物質(zhì)測每次聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析。實時熒光PCR試劑盒作為這一技術(shù)的載體,在醫(yī)學診斷、基因表達研究和遺傳疾病篩查等領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用。
一、工作原理
實時熒光PCR試劑盒的工作原理基于DNA聚合酶在PCR過程中合成新DNA鏈的特性,結(jié)合熒光標記的探針或染料,通過實時監(jiān)測熒光信號的增加來測量PCR反應(yīng)的進行程度。具體而言,工作過程包括以下幾個關(guān)鍵步驟:
1、DNA模板的擴增:PCR反應(yīng)中的DNA模板在DNA聚合酶的作用下,經(jīng)過一系列的溫度循環(huán)(變性、退火、延伸)進行擴增。每個循環(huán)中,DNA雙鏈在高溫下變性成單鏈,然后引物與單鏈DNA結(jié)合,并在DNA聚合酶的作用下合成新的DNA鏈。
2、熒光信號的實時監(jiān)測:在PCR反應(yīng)體系中加入熒光標記的探針或染料。這些熒光物質(zhì)在PCR反應(yīng)過程中,隨著DNA拷貝數(shù)的增加,與DNA產(chǎn)物結(jié)合并發(fā)出熒光信號。實時熒光PCR儀器通過檢測這些熒光信號的變化,實時監(jiān)測PCR反應(yīng)的進程。
3、熒光信號的定量分析:通過實時熒光PCR儀器收集到的熒光數(shù)據(jù),可以繪制成熒光強度相對于循環(huán)數(shù)的圖表。在PCR反應(yīng)早期,熒光信號較弱,隨著反應(yīng)的進行,熒光信號逐漸增強,進入指數(shù)增長期。當反應(yīng)達到一定的熒光強度閾值時,所需的循環(huán)數(shù)被稱為Ct值(Cyclethreshold)。研究表明,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。
4、定量計算:利用已知起始拷貝數(shù)的標準品制作標準曲線,標準曲線的橫坐標代表起始拷貝數(shù)的對數(shù),縱坐標代表Ct值。對于未知樣品,只要獲得其Ct值,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數(shù)。
實時熒光PCR試劑盒中的熒光物質(zhì)可以分為兩類:熒光探針和熒光染料。熒光探針通常是一段與目標DNA序列互補的寡核苷酸,兩端分別標記有熒光基團和淬滅基團。當探針與目標DNA序列結(jié)合時,熒光基團和淬滅基團接近,熒光信號被淬滅。在PCR延伸過程中,DNA聚合酶將探針切割,熒光基團和淬滅基團分離,熒光信號增強。熒光染料則是一種能夠非特異性地結(jié)合到DNA雙鏈上的小分子,當DNA雙鏈增多時,染料結(jié)合量增加,熒光信號增強。
二、優(yōu)勢
實時熒光PCR試劑盒相比傳統(tǒng)PCR方法具有以下幾個顯著優(yōu)勢:
1、快速準確:實時熒光PCR能夠在較短時間內(nèi)完成DNA的檢測和定量,通常只需幾個小時。同時,通過實時監(jiān)測熒光信號的變化,能夠提供可靠的擴增效率和準確的定量結(jié)果。
2、高靈敏度:能夠檢測極少量的目標DNA序列,甚至達到單拷貝水平的靈敏度。這使得實時熒光PCR成為檢測低濃度DNA樣本的理想選擇。
3、定量檢測:實時熒光PCR通過熒光信號的變化,可以對DNA產(chǎn)物進行實時定量檢測,無需后續(xù)分析。這一特性使得實時熒光PCR在病毒載量監(jiān)測、基因表達研究等領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用。
4、多重檢測:通過使用不同的熒光標記和探針,可以同時檢測多個DNA序列。這一特性大大提高了檢測效率,減少了樣本量和試劑消耗。
5、自動化和高通量:實時熒光PCR試劑盒可以與實時熒光PCR儀器結(jié)合使用,實現(xiàn)自動化操作和高通量檢測。這使得實時熒光PCR成為處理大量樣本的理想選擇,特別適用于大規(guī)模篩查和診斷。
6、廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域:實時熒光PCR試劑盒在醫(yī)學診斷、基因表達研究、遺傳疾病篩查、藥物療效考核、腫瘤基因檢測等領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用。通過實時熒光PCR技術(shù),我們能夠更好地了解DNA的特性,推動科學研究和醫(yī)學診斷的進步。
三、應(yīng)用案例
1、醫(yī)學診斷:實時熒光PCR技術(shù)在醫(yī)學診斷中具有重要作用。例如,在結(jié)核菌基因診斷中,實時熒光PCR可以區(qū)分結(jié)核桿菌與其他分枝桿菌,檢測結(jié)核桿菌的耐藥基因,提高結(jié)核病的陽性檢出率。在產(chǎn)前診斷中,實時熒光PCR可以從孕婦的外周血中分離胎兒DNA,進行無創(chuàng)傷性的性別鑒定和遺傳性疾病篩查。
2、基因表達研究:實時熒光PCR技術(shù)是研究基因表達的重要手段。通過實時熒光PCR技術(shù),可以定量檢測特定基因的表達水平,研究基因表達與疾病之間的關(guān)系,為疾病的診斷和治療提供科學依據(jù)。
3、遺傳疾病篩查:實時熒光PCR技術(shù)在遺傳疾病篩查中發(fā)揮著重要作用。通過檢測特定基因的突變或缺失,可以預(yù)測個體患遺傳疾病的風險,為早期干預(yù)和治療提供依據(jù)。
4、藥物療效考核:實時熒光PCR技術(shù)在藥物療效考核中具有重要應(yīng)用。例如,在乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)的定量分析中,實時熒光PCR可以檢測病毒載量,評估藥物的療效和病毒變異情況。
5、腫瘤基因檢測:實時熒光PCR技術(shù)在腫瘤基因檢測中具有廣泛應(yīng)用。通過檢測腫瘤相關(guān)基因的突變和表達水平,可以預(yù)測腫瘤的發(fā)生和發(fā)展,為腫瘤的診斷和治療提供科學依據(jù)。